牛病毒性腹泻病与其他几种疾病的鉴别诊断具有重要意义。首先，需要区分的是牛病毒性腹泻病、恶性卡他热、口蹄疫、蓝舌病和传染性鼻气管炎。这些疾病在临床表现上的差异是很明显的。

对于牛病毒性腹泻来说，它通常以口腔炎为起始症状，然后迅速发展成剧烈的腹泻，并伴随粪便变得异常稠厚。而恶性卡他热则以末期阶段出现严重的腹泻，而口蹄疫和蓝舌病在这一点上表现得相对较轻微，甚至可能完全没有出现腹泻的情况。至于传染性鼻气管炎，其影响也主要集中在呼吸道和神经系统上，虽然有时也会伴随轻微的腹泻，但这种情况并不常见。

此外，这些疾病还存在眼部症状上的差异。在牛病毒性腹泇中，没有任何眼部症状，而口蹄疫同样如此。而恶性的卡他热则会导致眼睛出现充血和糜烂，还可能伴随角膜浑浊。此外，蓝舌 病以及传染性鼻气管炎都可能引发眼部感染。

从咽喉部位来看，这些疾病也有其独特之处。例如，在牛 病毒 性 腹 泉 中 ， 咽 喉 部 分 可 能 会 出 现 糜 烂 性 坏 死 的 疾 症 表 现 ； 而 在 恶 性 卡 他 热 中 ， 咽 喉 部 分 则 展现出充血并且糜烂，但不会形成水泡。在口蹄疫中，则会有水泡并溃烂；而在蓝舌 病 中 ， 咽 喉 部 分 也 有 糜 烂 的 现 象 ； 最 后 在 传 染 性 鼠 气 管 炎 中 ， 软 腭 上 可能会形成脓疱。

此外，从体表部分而言，只有恶性的卡他热、口蹄疫以及蓝舌痘才有明显的皮肤变化，如丘疹、疱疹、龟裂或坏死。此外，有一些特殊情况下如脑膜炎或者生殖道感染等，都可作为进一步鉴别的手段。但是在牛 病 毒 性 腹 泞 患者中，则更倾向于流产或产出的小脑缺陷的小牲畜。

最后，在进行具体诊断时，还需考虑到各个疾患在组织学上的特征。在牛 病 毒 性 腹 泞 患者中，可以观察到消化道黏膜内大量烂斑及溃疡。而在恶性的卡他热患者身上，则可以看到消化道黏膜充血并伴随着烫伤般的情况。在口 蛰 疾 患者 身 上，可见心肌变质带来的颜色改变；而蓝舌患者则呈现脾脏与肾脏增大，以及肌肉出血、变质及水肿等问题；同时，他们还容易出现烤嘴头的情况。而最后，在患了传染式鼻子气管炎的人们身上，最典型的是发现了呼吸道黏膜炎症以及脑髓及非化脓觉神经节炎带来的各种神经症状。这一切都将成为医生进行准确诊断所依据的一个关键因素。