引进鸭种蛋时需要长途运输，如果保护不当，往往引起种蛋破损和蛋黄系带松弛，气室破裂等致使孵化率下降。运输种蛋时首先要妥善包装好，包装时可用塑料箱、木箱、竹箱、条箱等，但必须牢固和透气。最好用规格统一的种蛋箱，每层有蛋托相隔。如果用一般箱运输，箱内种蛋应用锯末、稻糠、麦秆等物填充隔离好，以防震动破坏；填充物应干燥、不发霉，无异味；蛋箱的周围、底箱的周围、底部及顶部应多填些。蛋的大头向上，小头向下，蛋与蛋之间不宜靠得太紧，以防震动破坏。

运输工具要可靠，运输途中要平稳，尽量避免剧烈颠簸和震荡，冬季注意保温，夏季防暑热和雨淋。