牛病毒性腹泻病与其他几种疾病的区别诊断是牧场健康管理中的一项重要任务。首先，需要明确牛病毒性腹泻病在感染后会导致剧烈的腹泻，而粪便随着时间逐渐变成稠泥。而恶性卡他热则是在末期阶段才出现严重的腹泻情况。口蹄疫虽然也会引起腹泻，但症状相对较轻微。而蓝舌病和传染性鼻气管炎中的腹泻情况更是非常轻微。

此外，在眼部症状上，牛病毒性腹泻无视觉异常，而口蹄疫同样没有眼部发作。然而，恶性卡他热可能伴有眼炎、角膜浑浊的情况。蓝舌病和传染性鼻气管炎则均表现为眼部症状，但不同于恶性卡他热，它们不会出现水泡或糜烂。

在口腔和鼻咽的损害方面，牛病毒性腹泇呈现糜烂坏死；而恶性卡他热则表现为充血、糜烂但不见水泡；口蹄疫特点是存在水泡并且溃烂；蓝舌病常见糜烂迹象；传染性鼻气管炎则以软腭上方形成脓疱为特征。此外，只有牛病毒性的暴露和口蹄疫两者都未显示出任何脚部问题。

皮肤上的变化也是关键区分：恶劣环境下可能出现丘疹、疱疹、龟裂以及坏死；乳房区域在口蹄疫中经常发生水泡甚至坏伤的情况；而传染型哮喘带来的影响还包括脑膜炎及生殖系统感染等，并且可以造成流产或生产缺陷的小牲畜。但对于牛瘟来说，它主要表现为消化道黏膜大量烂斑与溃疡的问题，同时心肌也有所改变，使得心脏形态不再正常。

最后，从组织学观察来看，对于各种疾患来说其特定的标志各异：消化道黏膜处满目皆是烂斑与溃疡，这正是瘟痨最典型的表现形式。在加之心肌变性的痕迹，以及多个器官（如脾脏肿大、肾脏增大）及肌肉出血/变质/浮肿等状况，可以判断其是否属于蓝色舌头综合征。而对于新颖哮喘，其主要表现在呼吸道黏膜通红痛苦，一些神经系统受损，如脑细胞受损以及非感冒性的神经节炎，也是一个诊断标准。