牛病毒性腹泻病与其他几种疾病的鉴别诊断具有重要意义。首先，需要区分的是牛病毒性腹泻病、恶性卡他热、口蹄疫、蓝舌病和传染性鼻气管炎。这些疾病在临床表现上存在显著差异。

牛病毒性腹泇主要以剧烈的口腔炎为特征，随后会伴随着大量粪便排出体外，并且粪便逐渐变得稠厚。相比之下，恶性卡他热的末期症状也包括了严重的腹泻，而口蹄疫则表现为轻微的腹泻情况。蓝舌病则没有出现腹泻的情况，而传染性鼻气管炎可能伴有轻微的腹泻。

在眼部症状方面，牛病毒性腹泇并未表现出眼部异常，而口蹄疫同样没有眼部症状。而恶性卡他热则常见于眼睛发炎以及角膜混浊的情况。而蓝舌病和传染性的鼻气管炎都可能导致眼睛发炎。

此外，这些疾病在口腔和鼻咽部均可见到感染迹象，但其具体表现在不同：牛 病毒 性 腹 泉 病 中 的 口 鼂 部 显 现 糜 烂 性 坏 死；而 恶 性 卡 他 热 则 展示充血糜烂但无水泡；口 蹄 疫 则 有 水 泡 并 溃 烂；蓝 舌 病 中 的 口 鼂 部 可 见 糜 烂；而 传 染 性 喉 咸 炎 则 表现 为 软 腭 上 有 脓 肿。

值得注意的是，只有口蹄疫和蓝舌病才会引起蹄部感染问题。而恶 性 卡 他 热 在皮肤上可见丘疹、疱疹、龟裂及坏死。此外，患有这两种疾ease的人还可能出现乳房水泡或烂斑的问题。而对于传染性的喉咽 炎来说，还可能发展成脑膜炎或者对生殖系统造成影响，如流产或是生殖道感染。在某些情况下，即使不治疗，也能导致流产或新生儿产生大脑缺陷的问题。

从组织学角度来看，当进行消化道黏膜检查时，可以发现牛痢虫所致的大量溃疡和烂斑。这一点与恶劣天气条件下的心脏变色变化形成鲜明对比，因为后者的特点是心肌细胞受损，从而影响到了正常的心脏功能，使得心脏呈现不一致色泽且条纹形态。此外，对于患者进行检查时，可观察到蓝舟综合征中患者显示出的肝脏增大，以及肌肉中的出血、变硬及浮动状态，这也是该疾ease的一个标志之一。此外，不同类型的小小畸形都会带来不同的健康风险，因此，在确诊之前，对每一种可能性都应给予足够关注。