2月27日上午，中央、国务院在北京隆重举行国家科学技术奖励大会。党和国家、、曾、出席大会并为获奖代表颁奖。
2006年度国家自然科学奖授奖项目29项，其中一等奖2项，二等奖27项；国家技术发明奖授奖项目56项，其中一等奖1项，二等奖55项；国家科学技术进步奖授奖项目241项，其中特等奖1项，一等奖20项，二等奖220项；授予2名外籍科学家中华人民共和国国际科学技术合作奖。
其中，由我院主持完成的6项成果获2006年度国家科学技术进步奖二等奖。它们是：优质高效型油菜中双9号的选育及其重要性状的分子基础研究（油料作物研究所），甜、辣椒优异种质创新与新品种选育（蔬菜花卉研究所），高产、优质、多抗、广适棉花杂交种——中棉所29选育及推广应用（棉花研究所），野生与特色棉花遗传资源的创新与利用研究(棉花研究所)，微生物农药发酵新技术新工艺及重要产品规模应用（农业环境与可持续发展研究所），鸡传染性喉气管炎重组鸡痘病毒基因工程疫苗（哈尔滨兽医研究所）。此外，我院生物技术研究所、农业信息研究所、作物科学研究所、柑桔所参与完成的4项成果也分别获得国家科学技术进步奖二等奖。
大会号召，全国科学技术工作者要向全体获奖者学习，继续发扬团结协作、顽强拼搏、开拓创新的精神，大力推进原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新，坚持走中国特色自主创新道路，努力实现自主创新能力的跨越式发展，为建设创新型国家和建设社会主义和谐社会做出更大的贡献。